1. Havo sifati: Kapsül mehmonxonasining kichik maydoni tufayli shamollatish oson emas, bu havo sifatini osongina pasayishiga olib kelishi mumkin, bu esa yo'lovchilarning hayoti va sog'lig'iga xavf tug'diradi.
2. Maxfiylik bilan bog'liq muammolar: Kapsülli mehmonxona har bir kishi uchun bo'lgani uchun xavfsizlik va maxfiylik muammolari paydo bo'lishi mumkin.
3. Ob'ektlar va jihozlar: Kapsülli mehmonxonalardan foydalanish juda kichik va bo'sh joyni kamaytirish uchun ba'zi ob'ektlar va jihozlar juda soddalashtirilgan, bu esa sayohatchilarning ehtiyojlarini qondirmasligi mumkin.
